Mgwas (metabolome Genome Wide Association study) fait référence à l'analyse d'association à l'échelle du génome basée sur la Métabolomique et est une méthode d'analyse d'association des données du Métabolome en tant que phénotype avec des données génotypiques. Comme les données du Métabolome sont plus fines pour l'identification phénotypique, l'analyse d'association est plus précise que l'analyse gwas traditionnelle.

L'équipe du professeur Roger de l'Université de Hainan et de l'université agricole de Chine centraleLe domaine mgwas est bien établi, avec plus de 10 études pertinentes publiées dans des revues à haut score ces dernières années.

Le 7 décembre 2020, la revue Nature Plants a publié en ligne un nouvel article de l’équipe du professeur Roger, « Selection of a Subspecies - specific Diterpene Gene Cluster implemented in Rice Disease Resistance », qui a été analysé en profondeur pour des grappes de gènes liés à la voie de synthèse des composés diterpéniques dans le riz. Les diterpènes sont l'une des principales espèces d'antimicrobiens végétaux dans le riz, et cette étude a identifié un gène codant pour l'ensemble de la voie de biosynthèse du 5,10 - dicétoricinocène (membre d'un dérivé monocyclique du ricinocène) sur le Chromosome 7 (dgc7).Clusters.

Article adopte la technologie de détection de groupe métabolique- technologie de détection de Métabolome largement ciblée pour atteindre un débit élevé, une sensibilité élevée, une large couverture et une détection non différenciée1000 métabolites, études métabolomiques et multiomiques assistées.

Identification de grappes de gènes diterpéniques dans le riz

Cette étude utilise un coupleur de spectrométrie de masse triple quadrupôle par chromatographie liquide à très haute performanceLCMS-8060， Les feuilles de tabac Ben infestées ou non avec les candidats correspondents ont été analysées par spectrométrie métabolique et les témoins 10 - cétone ricinocène et 5,10 - dicétoricinocène ont été purifiés à partir de feuilles de riz.

Spectrogramme de masse du 5,10 - dicétoricinocène

imageA est le produit de la surexpression simultanée d'ostps28, oscyp71z2 et oscyp71z21 dans les feuilles de tabac Ben

imageB est la norme 5,10 - dicétoricinoléne

Spectromètre de masse en série utilisé dans cet articleLcms - 8060 et gcms - tq8040 (photographiés au laboratoire d'amélioration génétique des cultures de l'Université d'agriculture de Huazhong)